会社をたたむのか、それとも再建を目指すのかで大きく２つの方向性があります。
再建を目指す場合に、今ある会社の枠組みを残したまま民事再生や会社更生といった法的手続をとる場合もありますし、話し合いにより債権者と協議する方法もあります。また、事業と従業員を別会社に移した上で、現会社を閉鎖するという事業譲渡方式の再生も考えられます。

それぞれの手続にはメリットとデメリットがあります。
債権者の協力は得られるか、法的手続による営業の一時停止が与える影響や仕入れ継続の可否、許認可の承継など様々な要素を勘案して、とるべき方策を決定する必要があります。